من أهداف مركز اللقاء:
· أن يفهم ويقبل المسيحيون والمسلمون بعضهم البعض من أجل خلق مناخ مناسب للعيش المشترك.
· تشجيع الحوارات الدينية والثقافية بين مختلف الشعوب والأديان في الأرض المقدسة.
· التأكد على عدم استخدام الدين للمصالح الشخصية والسياسية.
· العمل على تحقيق العدل والسلام ومساعدة المظلومين والفقراء والمهمشين في نيل حقوقهم.
· التركيز على القضايا الملحة والمشاكل التي تواجه المجتمع.
· التوعية بأهمية وجود التعددية والديمقراطية والمجتمع المدني والالتزام بحقوق الإنسان.
· تطوير الوعي عند الشباب والالتزام بخدمة المجتمع وتحقيق السلام.
· عقد المحاضرات والمؤتمرات والأيام الدراسية لتعزيز رسالة اللقاء.
· إصدار النشرات والمجلات والكتب لنشر رسالة المركز محلياً ودولياً.
· إجراء دراسات حول الكنيسة المحلية وتطوير فكر لاهوتي فلسطيني وأبحاث إسلامية ومسيحية.
· العمل على الحوار بين الثقافات والأديان بهدف ترسيخ أسس العدل والسلام بين جميع الشعوب.